19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4264 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4264    100 
 
 		 234 bp  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 990 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 984 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  83.94 
 
 		 951 bp  137  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  83.49 
 
 		 990 bp  129  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  83.49 
 
 		 951 bp  129  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  83.21 
 
 		 990 bp  67.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  83.21 
 
 		 861 bp  67.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  87.5 
 
 		 966 bp  63.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  87.5 
 
 		 567 bp  63.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  88.14 
 
 		 912 bp  61.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0371  hypothetical protein  88 
 
 		 252 bp  52  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2572    86.27 
 
 		 99 bp  46.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>