32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2808 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2808  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1439  hypothetical protein  79.49 
 
 
51 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135717  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6798  hypothetical protein  81.58 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585232  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2091  hypothetical protein  82.05 
 
 
51 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0017  hypothetical protein  80 
 
 
48 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1643  hypothetical protein  81.58 
 
 
48 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1132  hypothetical protein  78.95 
 
 
48 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1121  hypothetical protein  78.95 
 
 
48 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1704  hypothetical protein  81.58 
 
 
48 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252579  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2649  hypothetical protein  75 
 
 
50 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1977  hypothetical protein  76.92 
 
 
50 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2809  hypothetical protein  70.27 
 
 
47 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1741  hypothetical protein  76.92 
 
 
50 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869868  normal  0.0905796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2850  hypothetical protein  72.97 
 
 
47 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3015  hypothetical protein  72.97 
 
 
50 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3305  hypothetical protein  93.33 
 
 
50 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1241  hypothetical protein  90 
 
 
50 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6703  hypothetical protein  81.25 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410572  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3208  hypothetical protein  64.86 
 
 
51 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1242  hypothetical protein  72.73 
 
 
51 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2359  hypothetical protein  64.86 
 
 
51 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0876392  normal  0.116908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1098  hypothetical protein  75.76 
 
 
51 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0448109  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1223  hypothetical protein  75.76 
 
 
51 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.675037  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5577  hypothetical protein  78.12 
 
 
48 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733638  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5281  hypothetical protein  78.12 
 
 
48 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1149  hypothetical protein  66.67 
 
 
47 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0544  hypothetical protein  67.5 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.03794  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2584  hypothetical protein  64.86 
 
 
51 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3377  hypothetical protein  80.65 
 
 
47 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356732  normal  0.170123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4344  hypothetical protein  69.7 
 
 
51 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0611  hypothetical protein  70.97 
 
 
47 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0495  hypothetical protein  61.11 
 
 
46 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>