28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0611 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0611  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1439  hypothetical protein  67.39 
 
 
51 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2091  hypothetical protein  67.39 
 
 
51 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1977  hypothetical protein  68.18 
 
 
50 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1741  hypothetical protein  68.18 
 
 
50 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869868  normal  0.0905796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0017  hypothetical protein  63.64 
 
 
48 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1643  hypothetical protein  72.73 
 
 
48 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6798  hypothetical protein  65.91 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585232  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1704  hypothetical protein  65.91 
 
 
48 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252579  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0337  hypothetical protein  59.52 
 
 
45 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207605  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2649  hypothetical protein  56.82 
 
 
50 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1149  hypothetical protein  63.64 
 
 
47 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1121  hypothetical protein  63.04 
 
 
48 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1132  hypothetical protein  63.04 
 
 
48 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0544  hypothetical protein  60.42 
 
 
49 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.03794  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2809  hypothetical protein  67.44 
 
 
47 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2808  hypothetical protein  63.41 
 
 
51 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0495  hypothetical protein  56.1 
 
 
46 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3305  hypothetical protein  67.65 
 
 
50 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1241  hypothetical protein  64.71 
 
 
50 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3015  hypothetical protein  66.67 
 
 
50 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6703  hypothetical protein  67.57 
 
 
48 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410572  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2850  hypothetical protein  63.89 
 
 
47 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5577  hypothetical protein  64.86 
 
 
48 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733638  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5281  hypothetical protein  64.86 
 
 
48 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2277  hypothetical protein  60.87 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3377  hypothetical protein  54.76 
 
 
47 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356732  normal  0.170123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1242  hypothetical protein  60.61 
 
 
51 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>