29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1223 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1223  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.675037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1098  hypothetical protein  94.12 
 
 		 51 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0448109  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1242  hypothetical protein  88.24 
 
 		 51 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.488543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4344  hypothetical protein  86.27 
 
 		 51 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3208  hypothetical protein  74.51 
 
 		 51 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2584  hypothetical protein  68.63 
 
 		 51 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2359  hypothetical protein  66 
 
 		 51 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0876392  normal  0.116908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3015  hypothetical protein  74.47 
 
 		 50 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2850  hypothetical protein  65.96 
 
 		 47 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2809  hypothetical protein  61.7 
 
 		 47 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2091  hypothetical protein  84.85 
 
 		 51 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1439  hypothetical protein  75.76 
 
 		 51 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2808  hypothetical protein  75.76 
 
 		 51 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1741  hypothetical protein  61.36 
 
 		 50 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869868  normal  0.0905796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1977  hypothetical protein  61.36 
 
 		 50 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1643  hypothetical protein  75.76 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2649  hypothetical protein  65.12 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6798  hypothetical protein  75.76 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585232  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1704  hypothetical protein  75.76 
 
 		 48 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1132  hypothetical protein  65.79 
 
 		 48 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1121  hypothetical protein  65.79 
 
 		 48 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2892  hypothetical protein  68.09 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3118  hypothetical protein  68.09 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3377  hypothetical protein  58.7 
 
 		 47 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356732  normal  0.170123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0017  hypothetical protein  69.7 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0495  hypothetical protein  60.47 
 
 		 46 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0544  hypothetical protein  73.53 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.03794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1149  hypothetical protein  72.73 
 
 		 47 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6703  hypothetical protein  65.79 
 
 		 48 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410572  normal  0.610861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>