12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0049 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.866993  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0040  tRNA-Gln  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0202702  normal  0.855024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  96.67 
 
 
74 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  96.67 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  96.67 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>