299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0011 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0046  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0009  tRNA-Arg  90 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  91.8 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0024  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12800  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00502179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0006  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.436797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0009  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0013  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.249758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0058  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0068  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  0.377618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0001  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336526  hitchhiker  0.00896286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0006  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0067  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0010  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0011  tRNA-Arg  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  86.36 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>