18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2005 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2005  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.234873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0687  peptidase A24A prepilin type IV  50.19 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.890474  normal  0.372888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1915  peptidase A24A, prepilin type IV  53.14 
 
 		 393 aa  234  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.764763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2921  hypothetical protein  45.35 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0122  hypothetical protein  36.55 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1491  hypothetical protein  30.47 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0062  peptidase A24B, FlaK-like  29.76 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2136  peptidase A24A prepilin type IV  24.36 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0098  peptidase A24A prepilin type IV  28.27 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0855  Peptidase A24B, FlaK domain protein  24.26 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1780  Peptidase A24B, FlaK domain protein  28.05 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1052  preflagellin peptidase  23.23 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2090  peptidase A24B, FlaK-like protein  25.7 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0184  peptidase A24B, FlaK-like protein  23.79 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.932953  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1574  peptidase A24B, FlaK-like protein  21.18 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.95055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0338  peptidase A24B  21.96 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1752  peptidase A24A prepilin type IV  27.8 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1309  Peptidase A24B, FlaK domain protein  24.86 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>