19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1983 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1983  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  393  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2576  hypothetical protein  58.47 
 
 
194 aa  228  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1896  hypothetical protein  50.8 
 
 
191 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.473881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1283  hypothetical protein  40.64 
 
 
193 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.578821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2616  hypothetical protein  46.03 
 
 
193 aa  157  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1895  hypothetical protein  36.87 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.702818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1518  hypothetical protein  36.95 
 
 
211 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2177  hypothetical protein  32.16 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.490755  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1698  hypothetical protein  36.36 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.960334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2144  hypothetical protein  33 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494516  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2558  hypothetical protein  29.44 
 
 
215 aa  89  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.237964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0345  Zn-finger protein-like protein  30.96 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0017  hypothetical protein  26.56 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0526  hypothetical protein  26.26 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1694  hypothetical protein  32.12 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0218  hypothetical protein  29.65 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0906  hypothetical protein  29.15 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0758  hypothetical protein  29.69 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1523  hypothetical protein  28.43 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>