13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1928 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1928  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1138  zinc finger protein  64.71 
 
 
69 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0207  zinc finger protein  61.76 
 
 
71 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.423209  normal  0.336406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1693  zinc finger protein  61.76 
 
 
71 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0852  hypothetical protein  65.22 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0785  zinc finger protein  58.82 
 
 
71 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0148  zinc finger protein  61.54 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0240  zinc finger protein  59.42 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665758  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1285  hypothetical protein  61.54 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.378904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2452  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2453  zinc finger protein  53.03 
 
 
73 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054676  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2373  hypothetical protein  40.54 
 
 
78 aa  58.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2374  hypothetical protein  43.75 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>