17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0860 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1159    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  58.21 
 
 
578 aa  663    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  56.07 
 
 
578 aa  622  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  50.78 
 
 
580 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 
576 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  40.58 
 
 
583 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  33.39 
 
 
618 aa  283  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  32.41 
 
 
619 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  25.93 
 
 
566 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  24.8 
 
 
544 aa  100  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  23.92 
 
 
581 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  29.08 
 
 
536 aa  91.7  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  26.77 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  25.13 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  24.37 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  24.44 
 
 
589 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  23.63 
 
 
536 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>