11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5165 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5165    100 
 
 		 513 bp  1017    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190666  normal  0.220641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4700  integrase, catalytic region  91.26 
 
 		 198 bp  228  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  82.35 
 
 		 537 bp  141  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1392 bp  103  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  86.81 
 
 		 834 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  81.08 
 
 		 666 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    90 
 
 		 2579 bp  60  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  82.8 
 
 		 336 bp  58  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  90.48 
 
 		 966 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    96.43 
 
 		 980 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  88.64 
 
 		 567 bp  48.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>