47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2305 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2305  putative ferredoxin-NAD reductase component  100 
 
 		 313 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0479254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2030  putative ferredoxin-NAD reductase component  99.04 
 
 		 313 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1991  putative ferredoxin-NAD reductase component  92.65 
 
 		 313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1592  putative ferredoxin-NAD reductase component  55.7 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0274  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.35 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2336  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.91 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126537  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0136  ferredoxin  36.48 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0780915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2675  ferredoxin  36.31 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.237463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0219  ferredoxin  36.99 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  28.39 
 
 		 419 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  29.34 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.92 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.74 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.93 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  25.67 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0711  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.14 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.89 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.53 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.87 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  24.05 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  27.74 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  24.39 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.39 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.72 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  26.52 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.92 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  28.11 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.09 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  22.36 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  32.99 
 
 		 599 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.75 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  23.12 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.15 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.06 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  24.12 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3935  FMN reductase  29.38 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1910  FMN reductase  29.38 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0281  FMN reductase  29.38 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.493222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.98 
 
 		 562 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.65 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>