27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2335 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  280  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  31.93 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  30.25 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  31.09 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  33.62 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  29.57 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 215 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  30.25 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  31.09 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  29.41 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  29.41 
 
 		 175 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  29.41 
 
 		 175 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  29.41 
 
 		 175 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0379  flavodoxin FldA  32.46 
 
 		 160 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>