18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1657 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  60.11 
 
 
578 aa  697    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1181    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  55.71 
 
 
579 aa  656    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  52.09 
 
 
580 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 
576 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  41.75 
 
 
583 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  35.71 
 
 
618 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  31.72 
 
 
619 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  24.3 
 
 
566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  26.29 
 
 
535 aa  87  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  26.49 
 
 
544 aa  84  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  24.69 
 
 
581 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  25.47 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  25.24 
 
 
536 aa  65.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  23.06 
 
 
536 aa  63.9  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  23.12 
 
 
589 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  22.15 
 
 
533 aa  53.5  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  20.57 
 
 
538 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>