17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0196 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1176    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  41.92 
 
 
579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  43.44 
 
 
578 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  40.89 
 
 
578 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  38.96 
 
 
580 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
576 aa  351  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  30.89 
 
 
619 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  34.51 
 
 
618 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  25.15 
 
 
566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  25.44 
 
 
581 aa  98.6  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  29.07 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  26.82 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  24.71 
 
 
544 aa  67.4  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  22.84 
 
 
589 aa  64.3  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  26.49 
 
 
536 aa  64.3  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  26.88 
 
 
536 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  20.58 
 
 
533 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>