48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3128 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3128  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  621  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  37.25 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  36.66 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  36.51 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  34.82 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  35.2 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  34.5 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  148  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  32.12 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1425  phosphate uptake regulator, PhoU  30.49 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  31.17 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.282043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  28.01 
 
 		 336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  27.01 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  27.48 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2950  putative regulatory protein  29.67 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11037  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  27.94 
 
 		 336 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  26.88 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  28.39 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  28.06 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0353  phosphate uptake regulator, PhoU  26.72 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0896452  normal  0.250975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  28.43 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  26.11 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  25.41 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.198015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  27.94 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  27.94 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  22.81 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  25.32 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  22.08 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  21.77 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1600  phosphate uptake regulator, PhoU  26.78 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  24.38 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  22.19 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  21.81 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1015  phosphate uptake regulator, PhoU  22.04 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.313422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1329  phosphate uptake regulator, PhoU  28.8 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.445187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  26.53 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  28.89 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2081  phosphate uptake regulator, PhoU  26.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0893566 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0745  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133357  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0456  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  26.47 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  28.8 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>