14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2452 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2452  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0852  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2373  hypothetical protein  50.65 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0148  zinc finger protein  55.07 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1928  hypothetical protein  52.17 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1693  zinc finger protein  52.17 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0207  zinc finger protein  52.17 
 
 
71 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.423209  normal  0.336406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0240  zinc finger protein  50 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665758  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1138  zinc finger protein  50.72 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0785  zinc finger protein  50.72 
 
 
71 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1285  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.378904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2453  zinc finger protein  41.54 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054676  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2374  hypothetical protein  38.71 
 
 
75 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3681  hypothetical protein  31.34 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.10285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>