32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1175 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1175  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  955    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  30.31 
 
 		 273 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.11 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.87 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3381  hypothetical protein  24.46 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  hitchhiker  0.00468536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.65 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  26.05 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.63 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.11 
 
 		 286 aa  57  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  26.14 
 
 		 244 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.03 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  24.44 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0130  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.45 
 
 		 228 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3390  putative cytochrome c-type biogenesis protein  25.73 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.927366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  23.98 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.27 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.98 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.79 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.98 
 
 		 565 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.2 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.35 
 
 		 595 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.35 
 
 		 595 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.35 
 
 		 595 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1670  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.32 
 
 		 216 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1604  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.32 
 
 		 216 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.86 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.86 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.86 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.57 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  26.59 
 
 		 216 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>