40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0190 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0190  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  984    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0306  dihydropteroate synthase  54.18 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0717  dihydropteroate synthase-related protein  48.39 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0215  dihydropteroate synthase-related protein  42.34 
 
 		 470 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2299  dihydropteroate synthase-related protein  41.88 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2402  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 		 471 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  40.88 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1829  dihydropteroate synthase-related protein  33.14 
 
 		 523 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0827  dihydropteroate synthase-related protein  34.49 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1090  dihydropteroate synthase-related protein  33.53 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0516227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0605  dihydropteroate synthase-related protein  32.89 
 
 		 530 aa  256  9e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0892  dihydropteroate synthase-related protein  33.14 
 
 		 523 aa  253  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1673  hypothetical protein  35.6 
 
 		 475 aa  246  6e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.293824  hitchhiker  0.0000000161519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0631  dihydropteroate synthase-related protein  30.54 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498786  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0222  dihydropteroate synthase-related protein  30.68 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1245  pterin-binding domain-containing protein  27.29 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4100  dihydropteroate synthase DHPS  27.16 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1581  dihydropteroate synthase, DHPS  26.61 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00143208  unclonable  0.000000236622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5017  dihydropteroate synthase DHPS  25.96 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3075  dihydropteroate synthase DHPS  26.09 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2035  dihydropteroate synthase DHPS  26.12 
 
 		 489 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2616  pterin-binding domain-containing protein  25.79 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.521784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5321  dihydropteroate synthase DHPS  26.64 
 
 		 471 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2394  dihydropteroate synthase DHPS  27.11 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3143  dihydropteroate synthase DHPS  25.15 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5941  dihydropteroate synthase DHPS  25.4 
 
 		 461 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1793  dihydropteroate synthase DHPS  26.6 
 
 		 524 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.425163  normal  0.963011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2441  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein  26.01 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2725  dihydropteroate synthase DHPS  28.88 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63462  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6492  dihydropteroate synthase DHPS  24.6 
 
 		 462 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.137356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1842  dihydropteroate synthase DHPS  26.75 
 
 		 524 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2177  dihydropteroate synthase DHPS  26.75 
 
 		 524 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339932  normal  0.330618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2280  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit A  40 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  27.22 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  26.2 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01171  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.792165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  28.92 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  28.16 
 
 		 347 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  24.87 
 
 		 275 aa  43.5  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01161  hypothetical protein  45.1 
 
 		 128 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0704273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>