49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3734 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3734  acyl-CoA-binding protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0123  acyl-coA-binding protein ACBP  54.65 
 
 
88 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000595584  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1134  acyl-CoA-binding protein  59.77 
 
 
84 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0103  acyl-CoA-binding protein  57.65 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000596303  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0342  acyl-CoA-binding protein  70.31 
 
 
85 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3085  putative acyl-CoA-binding protein  56.98 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0455  acyl-CoA-binding protein  58.62 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628298  normal  0.491613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0446  acyl-coA-binding protein ACBP  58.62 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330336  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01420  long-chain fatty acid transporter, putative  50.57 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2000  acyl-CoA-binding protein  54.02 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3532  acyl-CoA-binding protein  55.29 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2466  acyl-CoA-binding protein  52.87 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2522  acyl-CoA-binding protein  52.87 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1231  acyl-CoA-binding protein  54.02 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.162101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1940  acyl-CoA-binding protein AcbP  51.72 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0466887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0773  acyl-CoA-binding protein  56.47 
 
 
84 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859936  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1358  acyl-CoA-binding protein  51.72 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3227  acyl-CoA-binding protein  51.72 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.457766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2085  acyl-CoA-binding protein  51.72 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1947  acyl-CoA-binding protein  54.02 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2078  acyl-CoA-binding protein  54.02 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1366  acyl-CoA-binding protein  50 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.322711  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1583  acyl-CoA-binding protein  51.72 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2611  acyl-CoA-binding protein  51.72 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0394  acyl-CoA-binding protein  50 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044876  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2065  acyl-CoA-binding protein  52.87 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2046  acyl-CoA-binding protein  52.87 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6031  acyl-CoA-binding protein  52.87 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5355  Acyl-CoA-binding protein, ACBP  51.72 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1305  acyl-coA-binding protein ACBP  50.57 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150747  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4041  acyl-CoA-binding protein  52.94 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1239  acyl-coA-binding protein ACBP  49.43 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451854  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1394  acyl-CoA-binding protein  48.24 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971038  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2484  acyl-coA-binding protein ACBP  48.84 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515409  hitchhiker  0.000620664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1653  putative acyl-CoA-binding protein  49.43 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192969  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3509  acyl-CoA-binding protein  52.33 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0347  acyl-coA-binding protein ACBP  49.43 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1366  acyl-CoA-binding protein  45.35 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3254  acyl-CoA-binding protein  48.81 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.264963  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4032  acyl-coA-binding protein ACBP  47.06 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000477077  normal  0.553982 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32604  predicted protein  56.45 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000696357  normal  0.053185 
 
 
-
 
NC_006686  CND03160  long-chain fatty acid transporter, putative  44.44 
 
 
406 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31029  predicted protein  37.97 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48778  predicted protein  33.33 
 
 
351 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34529  predicted protein  38.57 
 
 
394 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2596  acyl-CoA-binding protein  32.53 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05904  Acyl CoA binding protein family (AFU_orthologue; AFUA_2G11060)  32.93 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.979863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01062  Acyl CoA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12300)  35.37 
 
 
376 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0773441 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14734  predicted protein  36.21 
 
 
211 aa  40  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>