36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3528 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  201  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  43.82 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  41.11 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  37.5 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  36.84 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  38.54 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  38.38 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  35.16 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  35.16 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  36.36 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  38.38 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  36.36 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  37.08 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  35.56 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  36.26 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  28.26 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  34.41 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  34.41 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  37.93 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  35.96 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  32.05 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  32.05 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  35.48 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  29.35 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  37.35 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5985  hypothetical protein  31.87 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  28.92 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  31.71 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  29.67 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  28.89 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  29.35 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>