20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1992 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  38.66 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  40.38 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  38.98 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  43.9 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  34.03 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  40.21 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  46.48 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  45.12 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  43.9 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  35.06 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 		 566 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>