27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R30 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R30  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 104 bp  206  8e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TCrrnaB5S  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TCrrnaA5S  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 151 bp  60  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0017  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111845  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0005  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0009  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0017  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0034  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0061  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.488897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0089  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0101  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0104  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0108  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0009  5S ribosomal RNA  96.55 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.10388  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0042  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 120 bp  46.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0029  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 120 bp  46.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 121 bp  46.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 117 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 110 bp  44.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  96.15 
 
 		 110 bp  44.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>