13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02183 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  90.91 
 
 
73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  90.91 
 
 
74 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  89.09 
 
 
73 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  89.09 
 
 
73 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  65.45 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  47.06 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  51.11 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  46.67 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  47.62 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  44.74 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  44.74 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>