31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4587 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  77.46 
 
 
275 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  41.61 
 
 
298 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  43.72 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  42.42 
 
 
298 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  42.42 
 
 
306 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  42.24 
 
 
287 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  41.56 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  34.69 
 
 
287 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  32.45 
 
 
273 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  32.38 
 
 
288 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  32.81 
 
 
289 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  31.51 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  29.51 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  28.93 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  30.8 
 
 
290 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  30.25 
 
 
333 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  30.94 
 
 
276 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  29.29 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  30.19 
 
 
271 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  30.19 
 
 
271 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  29.64 
 
 
258 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  30.5 
 
 
263 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  28.26 
 
 
258 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  29.6 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  26.84 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  27.43 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  32.21 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  33.82 
 
 
292 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  26.27 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  26.27 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>