33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3666 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  91.91 
 
 
287 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  63.51 
 
 
298 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  67.83 
 
 
298 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  68.95 
 
 
306 aa  360  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  69.23 
 
 
311 aa  338  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  39.57 
 
 
288 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  41.13 
 
 
280 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  38.58 
 
 
273 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  37.83 
 
 
287 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  40.69 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  34.63 
 
 
290 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  37.08 
 
 
293 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  36.36 
 
 
296 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  37.66 
 
 
289 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  36.93 
 
 
286 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  34.54 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  31.44 
 
 
258 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  27.41 
 
 
276 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  24.28 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  24.36 
 
 
271 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  24.36 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  25.97 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  29.51 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  24.48 
 
 
260 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  25.1 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  26.72 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  24.05 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  26.23 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  26.46 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  26.46 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  27.64 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>