16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2863 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  100 
 
 
272 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  48.03 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0426  hypothetical protein  34.29 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490973  normal  0.403275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  39.86 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2349  hypothetical protein  32.31 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3140  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  32.62 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  30 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  32.62 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  32.62 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  29.79 
 
 
178 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  27.63 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  28.26 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  27.81 
 
 
162 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  26.67 
 
 
163 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  26.17 
 
 
174 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>