8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2428 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2428  RES domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1583  hypothetical protein  69.16 
 
 		 215 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.164728  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5317  RES  43.68 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3432  RES domain protein  33.53 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3439  RES domain-containing protein  33.84 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1405  RES domain protein  26.04 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1176  hypothetical protein  27.56 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0802  RES domain-containing protein  33.1 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>