15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1868 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  55.33 
 
 		 318 aa  321  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1540  hypothetical protein  29.2 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5218  hypothetical protein  26.99 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2613  hypothetical protein  25.47 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13552  hypothetical protein  27.8 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00218816  hitchhiker  0.00000199189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4103  hypothetical protein  24.88 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.706455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1360  hypothetical protein  26.75 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5014  hypothetical protein  24.67 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4632  hypothetical protein  24.67 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4720  hypothetical protein  24.67 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2527  Acetoacetate decarboxylase  24.77 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3220  hypothetical protein  30.65 
 
 		 350 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111198  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1698  hypothetical protein  31.45 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>