12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1128 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1004    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.541844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0682  hypothetical protein  41.54 
 
 		 442 aa  360  4e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1894  hypothetical protein  45.75 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.557849  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1329  hypothetical protein  45.67 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.295723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  24.74 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2985  hypothetical protein  23.84 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1940  hypothetical protein  25.41 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1144  hypothetical protein  22.11 
 
 		 499 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.548609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5148  hypothetical protein  33.94 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2024  hypothetical protein  25.69 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534725  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1419  hypothetical protein  24.66 
 
 		 358 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4898  hypothetical protein  31.75 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>