26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0631 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0631  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  80.88 
 
 		 68 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  52.38 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0851  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  57.14 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  53.03 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5816  hypothetical protein  55.74 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595083  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  52.31 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  53.97 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  52.31 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0074  hypothetical protein  42.19 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.908723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  53.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  48.44 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  45.31 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  44.62 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0410  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5124  hypothetical protein  35.19 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>