More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C55 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008505  LACR_C55  ATPase for chromosome partitioning  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  33.08 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  29.5 
 
 
288 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5392  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.26 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.28494  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2979  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.02 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  31.29 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5868  replication-associated protein  28.09 
 
 
276 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0001  replication-associated protein  27.51 
 
 
276 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  30.38 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2938  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  27.17 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.19 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  27.27 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.53 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.01 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.35 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  31.42 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  27.16 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  32.71 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  27.91 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  28.76 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.28 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.67 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  28.12 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.46 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  24.71 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  26.2 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.67 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  26.82 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.36 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  28.29 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3570  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00412685  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.97 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  25.48 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  26.44 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  27.86 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  28.12 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  27.11 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.83 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.69 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  26.3 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  27.17 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.84 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.704382  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  25 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.69 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.25 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.84 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  26.72 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.22 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.22 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.64 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.86 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  26.23 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  26.52 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  26.69 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.63 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.13 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  27.14 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.12 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.39 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  26.67 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  27.97 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>