50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1888 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1888  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0808  foldase protein PrsA  38.18 
 
 
309 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000278355  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0492  protease maturation protein precursor  37.25 
 
 
380 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1447  peptidylprolyl isomerase  32.09 
 
 
298 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000237343  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C43  peptidylprolyl isomerase  28.97 
 
 
299 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1265  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.03 
 
 
312 aa  119  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000288264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0952  peptidylprolyl isomerase  29.59 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0962  peptidylprolyl isomerase  29.29 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1207  peptidylprolyl isomerase  29.05 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1119  peptidylprolyl isomerase  29.49 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.211203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0974  peptidylprolyl isomerase  29.49 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1041  peptidylprolyl isomerase  29.49 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1077  peptidylprolyl isomerase  29.59 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1145  peptidylprolyl isomerase  29.59 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1230  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  30.61 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4226  peptidylprolyl isomerase  26.8 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0107977  hitchhiker  0.00167093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0957  peptidylprolyl isomerase  26.87 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1066  peptidylprolyl isomerase  25.89 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0643  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.42 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1061  peptidylprolyl isomerase  25.89 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1243  peptidylprolyl isomerase  26.52 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1169  peptidylprolyl isomerase  26.2 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1084  peptidylprolyl isomerase  26.2 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.76 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1320  peptidylprolyl isomerase  26.45 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4126  peptidylprolyl isomerase  25.24 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.174381  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0809  peptidylprolyl isomerase  29.63 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1215  peptidylprolyl isomerase  24.68 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0878  peptidylprolyl isomerase  27.54 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1070  peptidylprolyl isomerase  26.13 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1277  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  26.58 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.297456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1280  peptidylprolyl isomerase  27.38 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2875  peptidylprolyl isomerase  25 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1928  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.24 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2368  peptidylprolyl isomerase  25 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775832  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1894  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.55 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.218926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2301  peptidylprolyl isomerase  25.82 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2144  peptidylprolyl isomerase  25.66 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2336  peptidylprolyl isomerase  25.66 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2357  peptidylprolyl isomerase  25.66 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2115  peptidylprolyl isomerase  25.66 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000762926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2178  peptidylprolyl isomerase  25.66 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0828286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2436  peptidylprolyl isomerase  25.33 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3023  peptidylprolyl isomerase  25.16 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2101  peptidylprolyl isomerase  25.08 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2492  peptidylprolyl isomerase  26.78 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0106  foldase protein PrsA  25.71 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.02 
 
 
495 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2359  peptidylprolyl isomerase  24.34 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1376  protein export protein PrsA, putative  24.21 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.002795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>