33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0303 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0303  transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  149  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  33.85 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2135  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 82 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160527 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1830  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 74 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 78 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  34.38 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  31.75 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  27.94 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>