14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  190  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  33.68 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  56.41 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  42.47 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  36.17 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  44.29 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  44.78 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  50.85 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  41.94 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  33 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  34.69 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  38.38 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  38.89 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0703  hypothetical protein  43.08 
 
 
214 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.388175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>