26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13590  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.486672  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2347  hypothetical protein  51.2 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2150  hypothetical protein  42.02 
 
 
127 aa  100  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252745  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6309  hypothetical protein  43.09 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0087  hypothetical protein  43.8 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2572  hypothetical protein  44.44 
 
 
130 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486576  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3618  hypothetical protein  48.8 
 
 
130 aa  94.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0549643  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1809  hypothetical protein  46.61 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2565  hypothetical protein  38.52 
 
 
127 aa  93.6  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1634  hypothetical protein  44.44 
 
 
134 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2530  hypothetical protein  43.8 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2277  hypothetical protein  41.46 
 
 
127 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0147  hypothetical protein  44.63 
 
 
128 aa  90.5  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3515  hypothetical protein  40.48 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1065  hypothetical protein  46.15 
 
 
130 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1550  hypothetical protein  44.63 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5503  hypothetical protein  46.67 
 
 
132 aa  87.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125578  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1968  hypothetical protein  43.44 
 
 
125 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1590  hypothetical protein  40.94 
 
 
133 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3367  hypothetical protein  43.7 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1957  hypothetical protein  40.5 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127418  hitchhiker  0.00000331602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3203  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00257301  normal  0.651911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1121  hypothetical protein  38.33 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705516  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2155  hypothetical protein  45.31 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1723  hypothetical protein  43.65 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1794  hypothetical protein  43.65 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>