24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  100 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  68.35 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  68.31 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  65.47 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  60.43 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  57.55 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  57.55 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  57.55 
 
 		 139 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  62.31 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  58.73 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  56.69 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  64.35 
 
 		 133 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  61.21 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  59.4 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  55.12 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  56.69 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  56.39 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  48.89 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  52.34 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  42.59 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  55.26 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  63.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  34.72 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  41.51 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>