28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01390  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  317  5e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4040  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2938  hypothetical protein  35.76 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00841158  hitchhiker  0.000372001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1878  hypothetical protein  33.83 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000380113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3883  hypothetical protein  39.49 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12640  hypothetical protein  35 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.80444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1374  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.719868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3143  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1257  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2725  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1903  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3497  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2937  TPR domain protein  31.67 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06045  hypothetical protein  31.53 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2967  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2974  TPR domain protein  32.2 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2308  TPR domain protein  31.67 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0457067  hitchhiker  0.00000000000588055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2927  TPR domain protein  32.2 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4835500000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2928  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2720  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2649  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2671  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 534 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6815  hypothetical protein  29.38 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 615 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  36.36 
 
 		 653 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>