27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4490 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  66.15 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  63.36 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  62.31 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  59.23 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  59.23 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  58.46 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  61.72 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  61.54 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  59.09 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  61.72 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  58.59 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  58.27 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  55.97 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  58.96 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  55.56 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  55.56 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  54.14 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  46.97 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  55.1 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  55.26 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  43.4 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  51.16 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  51.16 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  51.16 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  40.62 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  39.62 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>