18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4058 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4058  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3606  hypothetical protein  62.41 
 
 
309 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2601  hypothetical protein  60.55 
 
 
294 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4541  hypothetical protein  66.43 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5564  hypothetical protein  62.72 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2743  hypothetical protein  62.33 
 
 
312 aa  332  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3077  hypothetical protein  61.32 
 
 
295 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8493  hypothetical protein  62.9 
 
 
331 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.419584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0938  hypothetical protein  59.09 
 
 
311 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4017  hypothetical protein  60.88 
 
 
294 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1366  putative aldolase  57.51 
 
 
316 aa  311  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4490  hypothetical protein  63.98 
 
 
407 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5538  hypothetical protein  56.85 
 
 
289 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0821  hypothetical protein  56.29 
 
 
328 aa  295  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1802  hypothetical protein  57.92 
 
 
291 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.354933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0726  hypothetical protein  54.23 
 
 
289 aa  282  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0661  hypothetical protein  55.85 
 
 
287 aa  254  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5632  hypothetical protein  49.62 
 
 
304 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.331611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>