31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2970 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  457  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  44.78 
 
 
209 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  46.57 
 
 
211 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  44.61 
 
 
210 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  44.06 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  44.06 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  43.43 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  44.06 
 
 
205 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  44.33 
 
 
207 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  40.89 
 
 
220 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  40.89 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  44.28 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  43.56 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  42.08 
 
 
210 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  44.55 
 
 
210 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  39.3 
 
 
209 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  41.38 
 
 
207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  39.13 
 
 
220 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  44.22 
 
 
207 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  40.54 
 
 
210 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  39.2 
 
 
209 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  42.44 
 
 
221 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  38.97 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  43.23 
 
 
207 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  39.9 
 
 
203 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  40.88 
 
 
205 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  36.97 
 
 
214 aa  104  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  43.65 
 
 
214 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  33.01 
 
 
225 aa  95.5  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  33.18 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>