29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2083 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2083  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  326  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37010  conserved hypothetical protein TIGR00026  59.86 
 
 
153 aa  154  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2595  hypothetical protein  62.6 
 
 
151 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3126  hypothetical protein  54.48 
 
 
159 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.336493  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3957  hypothetical protein  58.78 
 
 
149 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1792  hypothetical protein  51.77 
 
 
164 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1450  hypothetical protein  40.41 
 
 
139 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2859  hypothetical protein  42.96 
 
 
146 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2903  hypothetical protein  42.96 
 
 
146 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234456  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3168  hypothetical protein  43.06 
 
 
145 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460452  normal  0.10109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2889  hypothetical protein  42.25 
 
 
146 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1141  hypothetical protein  51.94 
 
 
157 aa  103  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3415  hypothetical protein  42.96 
 
 
146 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0681528  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3003  hypothetical protein  47.37 
 
 
148 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0843  hypothetical protein  36.18 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1067  hypothetical protein  38.97 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0730  hypothetical protein  36.57 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0750  hypothetical protein  36.57 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.162502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0736  hypothetical protein  36.57 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.124352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0682  hypothetical protein  34.53 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0239425  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0948  hypothetical protein  33.82 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491817  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0702  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149977  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0689  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0024  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441006  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4571  hypothetical protein  36.97 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6228  normal  0.0680023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1520  hypothetical protein  35.64 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00240031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19300  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261784  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3245  hypothetical protein  38.96 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00724538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  29.06 
 
 
127 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>