47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1620 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  100 
 
 
136 aa  268  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  51.52 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  40.6 
 
 
135 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  41.94 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  42.11 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  38.05 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  35.77 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31350  hypothetical protein  39.68 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  28.45 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  30.58 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  33.04 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  30.58 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  30.4 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  32.85 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  29.31 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  30.25 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  27.87 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2043  protein of unknown function DUF180  33.87 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  27.05 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  32.79 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  33.04 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  24.62 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  27.87 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0210  protein of unknown function DUF180  34.85 
 
 
156 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.945041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  29.41 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  30.25 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  29.57 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  28.83 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  31.03 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  26.83 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  25.81 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  28.83 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  26.23 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  28.83 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  31.58 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  31.58 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  30.08 
 
 
140 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  23.28 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1592  flagellar assembly protein FliW  30 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  32.73 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  32.08 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1960  flagellar assembly protein FliW  26.5 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  28.21 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  28.93 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  33.07 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>