16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1365 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  100 
 
 
171 aa  327  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  43.67 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18490  hypothetical protein  36.5 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2513  secreted protein  36.84 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1596  hypothetical protein  41.3 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0390754  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  36.64 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  43.7 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  36.19 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  36.92 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  31.54 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2284  hypothetical protein  38.14 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0855432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  47.62 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  48 
 
 
192 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>