17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0262 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0262  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  190  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.623777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0296  hypothetical protein  62.35 
 
 
88 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0085  hypothetical protein  59.76 
 
 
89 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  61.73 
 
 
99 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1968  hypothetical protein  66.27 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128383  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  58.54 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0873  hypothetical protein  58.82 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1565  hypothetical protein  61.45 
 
 
90 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.679201  hitchhiker  0.00228497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4747  hypothetical protein  62.65 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16910  hypothetical protein  56.32 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331531  normal  0.123249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  56.25 
 
 
87 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3807  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3839  hypothetical protein  52.17 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  45.45 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  42.17 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  56.25 
 
 
418 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>