16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0412 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  65.52 
 
 
184 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  53.7 
 
 
156 aa  150  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  57.46 
 
 
169 aa  143  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  46.79 
 
 
208 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  50.93 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  38.27 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  37.21 
 
 
201 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  41.22 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  41.03 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  42.31 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  41.38 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  30.67 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  40.59 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  40.95 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>