19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1628 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1628  50S ribosomal protein L32  100 
 
 
48 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.901218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0375  50S ribosomal protein L32  97.92 
 
 
48 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0352  50S ribosomal protein L32  97.92 
 
 
48 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1336  50S ribosomal protein L32  91.67 
 
 
48 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  85.42 
 
 
50 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0235  50S ribosomal protein L32  87.5 
 
 
48 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 
48 aa  85.5  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0988  50S ribosomal protein L32  83.33 
 
 
48 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1773  50S ribosomal protein L32  75 
 
 
49 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 
57 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 
57 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  48.98 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  45.83 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  43.75 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  44.9 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  52.38 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10230  ribosomal protein L32  46.94 
 
 
57 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000453136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  44.9 
 
 
57 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>