17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2422 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  67.96 
 
 
619 aa  825    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  100 
 
 
618 aa  1227    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  36.21 
 
 
578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  35.22 
 
 
578 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  33.39 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  33.81 
 
 
580 aa  300  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
576 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  34.51 
 
 
583 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  26.03 
 
 
566 aa  150  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  28.13 
 
 
581 aa  121  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  25.4 
 
 
535 aa  94.4  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  26.65 
 
 
544 aa  90.9  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  26.57 
 
 
536 aa  84  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  25.58 
 
 
536 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  25.42 
 
 
589 aa  78.2  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  23.02 
 
 
536 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  23.56 
 
 
533 aa  65.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>