20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2183 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  69.54 
 
 
657 aa  848    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  69.89 
 
 
658 aa  869    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  75.69 
 
 
658 aa  882    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  100 
 
 
658 aa  1284    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  61.85 
 
 
697 aa  673    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.459934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  38.84 
 
 
654 aa  435  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  33.98 
 
 
662 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  36.21 
 
 
650 aa  352  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  34.36 
 
 
663 aa  344  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  34.14 
 
 
669 aa  336  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  32.37 
 
 
646 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  28.44 
 
 
767 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  32.42 
 
 
602 aa  168  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  30.56 
 
 
613 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  37.12 
 
 
662 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  28.49 
 
 
591 aa  157  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  33.06 
 
 
585 aa  147  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  28.04 
 
 
639 aa  142  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  28.52 
 
 
584 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  31.01 
 
 
583 aa  130  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>