11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5161 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5161  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  502  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.365528  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3464  hypothetical protein  40.46 
 
 
251 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1862  hypothetical protein  38.58 
 
 
263 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  29.89 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  27.55 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  25.88 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  29.78 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  27.72 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  27.88 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  25.29 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  25.57 
 
 
250 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>